L’écosystème d’une rivière peut être perçu comme une mosaïque d’unités possédant différentes combinaisons de conditions environnementales. La qualité de ces unités comme habitats pour le saumon est évaluée en considérant leur potentiel à offrir une protection adéquate contre les conditions difficiles rencontrées en été et en hiver ainsi que la présence de bons sites de fraie ou de nourriture abondante. Les modèles de qualité d’habitat sont les relations entre la valeur écologique de ces unités et les conditions environnementales spécifiques qu’on y retrouve. L’objectif principal de ce projet, qui s'est déroulé sur la branche principale de la rivière Sainte-Marguerite (Saguenay), était de développer une approche innovatrice de modélisation de l’habitat du saumon à l’échelle d’une rivière.