Comment rechercher un programme dans la base de donnée 'apt-get' ?

Réponse : Ouvrir un terminal et lancer la commande :

apt-cache search <mot-clef>

Ici, 'mot' est un mot-clé contenu dans la description du programme recherché. Vous pouvez en mettre plusieurs. Vous obtiendrez une liste de programme contenant le mot-clé utilisé. Installez ensuite votre programme avec la commande apt-get. Example :

sudo apt-get install <programme>

Comment se connecter à un serveur à distance (example : elias et logan) ?

Réponse : Ouvrir un terminal et tapper :

ssh LOGIN@elias.bioinfo.ulaval.ca

Où 'LOGIN' est votre nom d'utilisateur sur le serveur (ici elias). Lors de la première connexion, vous devrez confirmez que vous souhaitez bien vous connecter au serveur. Par la suite, vous devrez entrer votre mot de passe sur le serveur afin d'accéder à votre compte.

Quels outils flexibles et puissants est-ce que je devrais apprendre ?

Réponse :

• Unix/linux
• R (pour mathématiques, statistiques)
• Python ou Perl (traiter de larges fichiers, créer des programmes)
• grep, sed, awk (programmes disponibles sous Unix)
• Les expressions régulières (rechercher/remplacer avancé)
• Bases de données (utiliser et créer)